Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HBBP68871 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms