Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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FAM3BP58499 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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