Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBASH3AP57075 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms