Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BACE1P56817 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BACE1P56817 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BACE1P56817 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms