Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRCA2P51587 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRCA2P51587 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms