Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms