Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VEGFBP49765 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms