Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPFP49454 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPFP49454 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPFP49454 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPFP49454 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPFP49454 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPFP49454 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPFP49454 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPFP49454 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPFP49454 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPFP49454 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPFP49454 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPFP49454 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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CENPFP49454 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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CENPFP49454 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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CENPFP49454 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPFP49454 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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CENPFP49454 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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CENPFP49454 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPFP49454 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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