Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms