Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms