Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPOP42166 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPOP42166 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPOP42166 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPOP42166 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPOP42166 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPOP42166 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPOP42166 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPOP42166 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPOP42166 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPOP42166 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPOP42166 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPOP42166 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPOP42166 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPOP42166 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPOP42166 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPOP42166 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPOP42166 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPOP42166 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPOP42166 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPOP42166 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPOP42166 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPOP42166 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPOP42166 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPOP42166 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPOP42166 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPOP42166 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPOP42166 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPOP42166 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPOP42166 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPOP42166 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms