Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms