Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBX2P40425 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PBX2P40425 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBX2P40425 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBX2P40425 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBX2P40425 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBX2P40425 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBX2P40425 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBX2P40425 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBX2P40425 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBX2P40425 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 UCHL1-AS1-202ENST00000510073 451 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PBX2P40425 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBX2P40425 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBX2P40425 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBX2P40425 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBX2P40425 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBX2P40425 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBX2P40425 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBX2P40425 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBX2P40425 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBX2P40425 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBX2P40425 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBX2P40425 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PBX2P40425 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBX2P40425 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBX2P40425 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBX2P40425 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBX2P40425 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBX2P40425 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PBX2P40425 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms