Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OTX2P32243 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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OTX2P32243 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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OTX2P32243 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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OTX2P32243 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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OTX2P32243 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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OTX2P32243 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OTX2P32243 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
OTX2P32243 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
OTX2P32243 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
OTX2P32243 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OTX2P32243 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OTX2P32243 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
OTX2P32243 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
OTX2P32243 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OTX2P32243 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OTX2P32243 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OTX2P32243 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OTX2P32243 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OTX2P32243 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OTX2P32243 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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