Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms