Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK1P29120 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms