Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLD1P28340 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLD1P28340 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD1P28340 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD1P28340 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD1P28340 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD1P28340 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD1P28340 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD1P28340 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD1P28340 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD1P28340 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD1P28340 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD1P28340 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD1P28340 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD1P28340 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD1P28340 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD1P28340 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD1P28340 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD1P28340 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD1P28340 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms