Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL9A1P20849 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 AC010894.2-201ENST00000444196 561 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL9A1P20849 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms