Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms