Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEFHP12036 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEFHP12036 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEFHP12036 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms