Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F13BP05160 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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F13BP05160 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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F13BP05160 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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F13BP05160 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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F13BP05160 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F13BP05160 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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