Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG7O95352 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG7O95352 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG7O95352 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms