Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB3O43889 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms