Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC096759.2-202ENST00000515230 777 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC009630.2-201ENST00000524133 570 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC009630.2-202ENST00000578500 884 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATMINO43313 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATMINO43313 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATMINO43313 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATMINO43313 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATMINO43313 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATMINO43313 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 UBE2D3-202ENST00000338145 896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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ATMINO43313 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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ATMINO43313 LINC00879-205ENST00000470465 757 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATMINO43313 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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