Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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