Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

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Length 429 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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NPIPB9F8W1W9 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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NPIPB9F8W1W9 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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NPIPB9F8W1W9 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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NPIPB9F8W1W9 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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NPIPB9F8W1W9 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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NPIPB9F8W1W9 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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NPIPB9F8W1W9 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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NPIPB9F8W1W9 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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NPIPB9F8W1W9 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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NPIPB9F8W1W9 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPIPB9F8W1W9 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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