Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-1B6SEH8 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms