Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms