Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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