Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRAMEF22A3QJZ6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF22A3QJZ6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF22A3QJZ6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF22A3QJZ6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF22A3QJZ6 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF22A3QJZ6 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF22A3QJZ6 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF22A3QJZ6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF22A3QJZ6 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF22A3QJZ6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF22A3QJZ6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRAMEF22A3QJZ6 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRAMEF22A3QJZ6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms