Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAD54L2Q9Y4B4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAD54L2Q9Y4B4 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms