Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP1Q9UPQ3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms