Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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COPS3Q9UNS2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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COPS3Q9UNS2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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COPS3Q9UNS2 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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COPS3Q9UNS2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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COPS3Q9UNS2 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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