Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms