Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PPARGC1AQ9UBK2 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PPARGC1AQ9UBK2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PPARGC1AQ9UBK2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPARGC1AQ9UBK2 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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