Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3GQ9HC16 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms