Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM55Q9BYV6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms