Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms