Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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