Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ECHDC3Q96DC8 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ECHDC3Q96DC8 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ECHDC3Q96DC8 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ECHDC3Q96DC8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ECHDC3Q96DC8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ECHDC3Q96DC8 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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