Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RMDN1Q96DB5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms