Protein–RNA interactions for Protein: Q96B67

ARRDC3, Arrestin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC3Q96B67 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARRDC3Q96B67 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARRDC3Q96B67 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms