Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP13Q92995 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP13Q92995 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP13Q92995 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP13Q92995 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP13Q92995 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP13Q92995 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP13Q92995 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP13Q92995 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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