Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms