Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FAM71DQ8N9W8 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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