Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
GCSAMQ8N6F7 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms