Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PLD3Q8IV08 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PLD3Q8IV08 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms