Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PTF1AQ7RTS3 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PTF1AQ7RTS3 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PTF1AQ7RTS3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PTF1AQ7RTS3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PTF1AQ7RTS3 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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PTF1AQ7RTS3 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PTF1AQ7RTS3 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTF1AQ7RTS3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTF1AQ7RTS3 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTF1AQ7RTS3 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTF1AQ7RTS3 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTF1AQ7RTS3 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTF1AQ7RTS3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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