Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms