Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms